查重系统主要关注的是论文的正文内容，包括标题、段落、引用、图表说明等与学术内容直接相关的部分。页眉通常包含一些辅助性信息，如论文标题、页码、学校名称、作者姓名等，这些信息通常是固定的格式内容，不属于学术研究的核心部分，查重系统在检测时一般不会将其纳入重复率的计算范围。

然而，如果页眉中包含了与正文内容重复的重要信息，或者页眉中的某些内容被设置为与正文相同的格式且参与了查重范围的界定，那么可能会对查重结果产生一定影响，但这种情况比较少见。为了确保查重结果的准确性和可靠性，建议在撰写论文时，遵循学校或期刊的格式要求，正确设置页眉内容，避免在页眉中出现不必要的与正文重复的信息。

为确保论文顺利通过审核，页眉的格式设置不容忽视。规范的页眉不仅能体现论文的专业性和严谨性，也是学术规范的重要体现。统一、标准的页眉格式有助于塑造论文的整体形象，给评审者留下良好印象。此外，错误或不规范的页眉设置可能导致论文格式不统一，影响阅读体验，甚至可能因不符合学校或期刊的格式要求，而影响论文的最终成绩或发表结果。